集体奖
| 获奖名称 | 奖励类别 | 等级 | 获奖人 | 获奖时间 |
| 全国杰出专利工程技术评审预展 | 发明专利 | 优秀 | 阎锡蕴,杨东玲,沈毅,冯静,林芸等 | 2006.5 |
个人奖
| 获奖人 | 奖励类别 | 获奖时间 |
| 饶子和 | 2006年度陈嘉庚科学奖 | 2006 |
| 饶子和 | 2006年的里雅斯特科学（医学）奖 | 2006 |
| 徐涛 | 第十届中国青年五四奖章 | 2006 |
| 常文瑞 | 中国科学院研究生院优秀教师 | 2006 |
| 王大成 | 中国科学院研究生院优秀教师 | 2006 |
| 王志珍 | 全国三八红旗手 | 2006 |
| 陈畅 | “SFRR Asia Award for 2006” the 13th International Congress of the Society for Free radicals, Davos, Switzerland. | 2006 |
| 阎锡蕴 | 中国科学院五好文明家庭 | 2006 |